| Δημοτική Κοινότητα Ρεθύμνης |
|
| Δημοτική Κοινότητα Ατσιποπούλου |
|
| Τοπική Κοινότητα Αγίου Κωνσταντίνου |
|
| Τοπική Κοινότητα Άδελε |
|
| Τοπική Κοινότητα Αμνάτου |
|
| Τοπική Κοινότητα Άνω Βαλσαμόνερου |
|
| Τοπική Κοινότητα Αργυρουπόλεως |
|
| Τοπική Κοινότητα Αρμένων |
|
| Τοπική Κοινότητα Αρχαίας Ελεύθερνας (Πρινέ) |
|
| Τοπική Κοινότητα Αρχοντικής |
|
| Τοπική Κοινότητα Βιλανδρέδου |
|
| Τοπική Κοινότητα Γερανίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Γουλεδιανών |
|
| Τοπική Κοινότητα Γωνιάς |
|
| Τοπική Κοινότητα Ελεύθερνας |
|
| Τοπική Κοινότητα Επισκοπής |
|
| Τοπική Κοινότητα Έρφων |
|
| Τοπική Κοινότητα Ζουριδίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Καλονυκτίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Καρές |
|
| Τοπική Κοινότητα Καρωτής |
|
| Τοπική Κοινότητα Καστέλλου |
|
| Τοπική Κοινότητα Κάτω Βαλσαμόνερου |
|
| Τοπική Κοινότητα Κάτω Πόρου |
|
| Τοπική Κοινότητα Κούμων |
|
| Τοπική Κοινότητα Κούφης |
|
| Τοπική Κοινότητα Κυριάννας |
|
| Τοπική Κοινότητα Μαλακίων |
|
| Τοπική Κοινότητα Μαρουλά |
|
| Τοπική Κοινότητα Μέσης |
|
| Τοπική Κοινότητα Μούντρου |
|
| Τοπική Κοινότητα Μυριοκεφάλων |
|
| Τοπική Κοινότητα Όρους |
|
| Τοπική Κοινότητα Παγκαλοχωρίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Πηγής |
|
| Τοπική Κοινότητα Πρασιών |
|
| Τοπική Κοινότητα Πρινέ |
|
| Τοπική Κοινότητα Πρίνου |
|
| Τοπική Κοινότητα Ρουσσοσπιτίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Ρουστίκων |
|
| Τοπική Κοινότητα Σαϊτούρων |
|
| Τοπική Κοινότητα Σελλίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Σκουλουφίων |
|
| Τοπική Κοινότητα Φραντζεσκιανών Μετοχίων |
|
| Τοπική Κοινότητα Χαμαλευρίου |
|
| Τοπική Κοινότητα Χαρκίων |
|
| Τοπική Κοινότητα Χρωμοναστηρίου |
|